Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam178bQ24JP3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam178bQ24JP3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam178bQ24JP3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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