Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cpne9Q1RLL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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