Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd300lgQ1ERP8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd300lgQ1ERP8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms