Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpusd3Q14AI6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd3Q14AI6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpusd3Q14AI6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd3Q14AI6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Rpusd3Q14AI6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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