Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Traf3ip1Q149C2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Traf3ip1Q149C2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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