Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r2Q0VGB7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms