Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cntnap5bQ0V8T8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cntnap5bQ0V8T8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms