Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps8Q0P5W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps8Q0P5W1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms