Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc45a4Q0P5V9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc45a4Q0P5V9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms