Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn2bQ0KL01 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn2bQ0KL01 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms