Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NeblQ0II04 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NeblQ0II04 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms