Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Pate4Q09098 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pate4Q09098 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms