Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700061G19RikQ08EE8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700061G19RikQ08EE8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms