Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tff1Q08423 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tff1Q08423 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tff1Q08423 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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