Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CbfbQ08024 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms