Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ebf1Q07802 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ebf1Q07802 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms