Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Col17a1Q07563 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Col17a1Q07563 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms