Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NrepQ07475 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NrepQ07475 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms