Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AmbpQ07456 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AmbpQ07456 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AmbpQ07456 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmbpQ07456 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmbpQ07456 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmbpQ07456 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmbpQ07456 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AmbpQ07456 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AmbpQ07456 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AmbpQ07456 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms