Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah2Q06986 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms