Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prrx2Q06348 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrx2Q06348 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrx2Q06348 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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