Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Igsf9Q05BQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Igsf9Q05BQ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms