Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apoc2Q05020 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms