Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sox12Q04890 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sox12Q04890 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms