Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CkbQ04447 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms