Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kcnb1Q03717 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms