Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scg2Q03517 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scg2Q03517 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms