Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Crisp3Q03402 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Crisp3Q03402 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms