Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Thbs2Q03350 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thbs2Q03350 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms