Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nucb1Q02819 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nucb1Q02819 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms