Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col6a2Q02788 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Col6a2Q02788 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms