Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RykQ01887 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RykQ01887 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RykQ01887 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RykQ01887 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RykQ01887 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms