Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nme2Q01768 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nme2Q01768 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms