Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Serpina1cQ00896 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms