Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SeleQ00690 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SeleQ00690 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms