Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gbp10Q000W5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms