Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb4P99026 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb4P99026 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms