Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata5P97489 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata5P97489 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata5P97489 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gata5P97489 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gata5P97489 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms