Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp1P97350 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp1P97350 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms