Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RptnP97347 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RptnP97347 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RptnP97347 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RptnP97347 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RptnP97347 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RptnP97347 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RptnP97347 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RptnP97347 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms