Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Arf1P84078 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf1P84078 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf1P84078 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms