Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tubg1P83887 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubg1P83887 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms