Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NyxP83503 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NyxP83503 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NyxP83503 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NyxP83503 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NyxP83503 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NyxP83503 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NyxP83503 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NyxP83503 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NyxP83503 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NyxP83503 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NyxP83503 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms