Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gbx1P82976 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms