Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tbx6P70327 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms