Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vamp7P70280 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp7P70280 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms