Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrig1P70193 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrig1P70193 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms