Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hpcal1P62748 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hpcal1P62748 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms