Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps4xP62702 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps4xP62702 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms