Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snrpd1P62315 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snrpd1P62315 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms